A escola foi criada pelo decreto nº 504 de 05 de fevereiro de 1955, com o nome de Escolas Reunidas "Marcos Rovaris" e funcionou a partir daquele ano com quatro turmas, nas dependências do Bairro da Juventude.
Em 1960, dado ao elevado número de alunos, passou-se para o atual prédio escolar. Neste mesmo ano passou a Grupo Escolar.
Em 1994,começou a funcionar também o curso de Ensino Médio de Educação Geral, em turnos diurnos e noturnos, e a denominação para : Colégio Estadual Coronel Marcos Rovaris. No ano de 2000, obedecendo a portaria que padronizou a identificação das escolas estaduais, o nome foi alterado para ESCOLA DE EDUCAÇÃO BÁSICA CORONEL MARCOS ROVARIS.
Os alunos da escola têm tido boa participação e vitórias em variadas modalidades esportivas e também, pela qualidade do ensino oferecida, têm conseguido boas colocações no mercado de trabalho e aprovações nos exames vestibulares.